Na rok 2006 jsou plánovány 2 dlouhodobé výluky trati Libeň - Masarykovo nádraží.
Výluka 2.TK začne 19.4. a skončí 3.7., její délka je tedy 76 dní. Během této doby se musí kompletně dokončit opěrná zeď v místě rozšíření pro estakádu Sluncová (zemní práce, dokončení římsy, dokončení šachet nových propustků, kabelovod, atd.). Trakce i železniční svršek zde budou částečně zřízeny v provizorní podobě, tj. ve snížené niveletě, kvůli pozdější stavbě skruže pro estakádu. Zároveň se položí cca. 300 metrů nové koleje v napojení před žst. Libeň.
 Výluka 1.TK bude trvat od 4.7.06 do 17.7.07. Během ní s v podstatě musí téměř z nuly postavit nová dvoukolejná železniční estakáda "Sluncová", která spojí severní tunel s Libní. Její délka přes 300 metrů, návazné objekty, složitý tvar, problematický přístup a časové omezení výstavby z ní činí zřejmě nejnáročnější objekt Nového spojení.
 Poslední výluka znovu 2.TK (částečně v již nové trase koleje č.202) od 18.7. do 2.10.07 poslouží na dokončení té části koleje, kterou nelze kvůli osovým vzdálenostem realizovat v roce 2006. Mimo jiné se postaví nový most, jímž budou podcházet pěší z Karlína do nové parkové zóny mezi tratěmi.
 Délky a pořadí výluk jsou upraveny zhotovitelem, celkově však respektují časy dané původním projektem. Rozhodně nezahrnují přebytečné časové rezervy, při obtížnosti prací spíše naopak.

-jj-